❓국세청에서 종합소득세 수정하라고 연락 오면 어떻게 해야 할까?

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“국세청에서 ‘신고 내용 수정하라’는 연락이 왔다면… 벌금일까?”
종합소득세 신고 후 얼마 지나지 않아
국세청으로부터 수정 요청 연락이 오면
누구나 당황할 수밖에 없습니다.
하지만 모든 연락이 처벌이나 세무조사를 의미하는 건 아닙니다.
이번 글에서는 수정 요청이 오는 이유와
실제로 어떻게 수정하면 되는지, 가산세는 피할 수 있는지
정확하고 실용적인 정보를 제공합니다.

🧾 서론: 수정 요청, 벌점이 아니라 ‘기회’다

국세청의 종합소득세 수정 요청은
신고자가 제출한 내역과 국세청이 보유한 자료 간의 차이가 있을 때 발생합니다.
예를 들어,

누락된 수입
경비 과다 계상
공제 과잉 적용
이러한 항목에 대해 국세청이 검토 후 수정 필요하다고 판단하면
문자, 전화, 홈택스 알림 등을 통해
신고자에게 연락을 취합니다.

이때 즉시 대응하지 않거나 무시하면 정식 세무조사로 확대될 수 있습니다.
그러나 빠르게 사실 확인 후 수정하면
오히려 가산세를 감면받고, 리스크도 차단할 수 있습니다.

📌 본론: 국세청 수정 요청, 대표적인 5가지 유형

① 수입 누락: 원천징수 자료와 신고 내역 불일치

가장 흔한 이유입니다.
프리랜서 수입 중 일부가 누락되어
신고 금액이 실제보다 적은 경우입니다.

국세청은 각종 플랫폼, 기업, 기관으로부터 받은
지급명세서(원천징수 영수증)와
신고자의 종합소득세 신고서를 자동 비교합니다.

예:

유튜브 수익 일부 누락
강연료 한 건 미신고
기업 지급 내역 미반영

→ 이 경우 ‘수정 신고 요청 문자’가 발송됩니다.

② 경비 과다 계상: 업종 평균 대비 높은 비용 처리

일반적으로 업종별로 경비 비율에는
평균값이 존재합니다.

예를 들어,

디자인 업종 평균 경비율: 약 40~50%
하지만 신고자는 80% 이상 처리한 경우

국세청은 이를 이상 사례로 감지하여
정당한 비용인지 입증을 요구하거나
수정 신고를 권고합니다.

③ 소득과 경비 모두 누락된 경우

경비와 소득이 한꺼번에 빠진 경우
문제는 더 복잡해집니다.

특히 프리랜서가

한 거래처 전체 매출을 누락한 경우
경비 영수증과 세금계산서도 함께 누락된 경우

국세청은 신고 누락 의심과 함께
의도적 누락 여부를 판단해 정식 조사로 전환할 수 있습니다.
이럴 땐 신속한 자진 수정 신고가 핵심입니다.

④ 공제 또는 세액감면 항목 오류

기부금, 의료비, 교육비, 연금저축 등
공제 항목이 과도하게 적용됐거나
중복 입력된 경우에도 수정 요청이 옵니다.

예:

부양가족 2명인데 3명 공제 입력
교육비가 연간 300만 원인데 600만 원 기재

📌 이 경우, 증빙자료가 명확하다면 소명 가능
없다면 수정 신고 후 공제를 일부 철회해야 합니다.

⑤ 환급액이 비정상적으로 클 경우

국세청은 환급액이 일정 기준을 초과하는 경우
자동으로 ‘검토 대상’에 올립니다.

특히,

종합소득이 낮고
경비와 공제가 과도해
환급이 수백만 원 발생한 경우

→ 수정 요청이 오거나
→ 환급 보류 → 자료 확인 후 지급
의 절차를 따르게 됩니다.

🧭 수정 요청을 받았을 때의 대응 절차

✅ 1. 홈택스에서 신고서 확인하기

홈택스 로그인 후
[신고/납부] > [종합소득세] > [신고내역 조회]에서
기존 신고서를 다시 확인합니다.

특히 다음 항목을 중심으로 확인하세요:

소득 금액
원천징수 내역
경비 처리 항목
공제 내역

✅ 2. 누락되거나 잘못된 부분 확인

국세청 연락 내용과 신고서를 대조해
문제가 된 부분을 식별해야 합니다.

수입 누락: 지급명세서 조회
경비 과다: 카드/현금영수증 내역 재검토
공제 항목: 간소화 자료와 비교

✅ 3. 홈택스에서 ‘수정신고’ 진행

[신고/납부] > [종합소득세] > [수정신고서 작성] 메뉴에서
기존 신고서를 불러오고,
해당 항목만 수정하여 재제출합니다.

📌 신고서 내에 ‘수정사유’를 간단히 입력하면
검토에 도움이 됩니다.

✅ 4. 증빙자료 보완해 제출하기

세무서에서 별도 요청이 있다면
다음과 같은 자료를 준비해 제출합니다:

매출 누락: 입금 내역, 계약서, 이메일 내역
경비 과다: 카드 내역, 세금계산서, 명세서
공제 항목: 영수증, 기부금 확인서, 교육비 납입증명

📉 가산세, 피할 수 있을까?

수정 신고 시 가산세 여부는 상황에 따라 다릅니다.

상황	가산세 여부
자진 수정 신고	감면 또는 미부과
국세청 연락 후 수정	일부 부과 가능
수정 없이 무대응	과소신고 가산세 10~40% 발생

📌 따라서 연락 즉시 대응하고 수정하면
가산세 부담을 최소화할 수 있습니다.

🧾 요약 정리

수정 요청 유형	대응 방법 요약
수입 누락	지급명세서 대조 후 수정신고
경비 과다	증빙 준비 후 경비 조정
공제 항목 오류	증빙 확인 후 수정 or 소명
환급 과다	신고서 재검토 + 보완자료 제출
자진수정 vs 무대응	자진수정 시 가산세 감면 가능